Пиримидин асосидаги моддалар молекуласида бир неча реакцион марказлар мавжуд, яъни 1- ва 3-ҳолатлардаги азот атоми, С-4 даги карбонил гуруҳи ва бошқалар. Унинг бензоанологлари -2,3-три-, -тетра-, -пентаметилен-3,4-дигидрохиназолин-4-онларда қушимча бензол халқаси ва полиметилен халқаси ҳам бор.